直线电机具体使用在三个方面，一是用作自动控制系统中，这类使用比较多，首先是驱动电机长期连续运行，三是用作需要短时间、短距离提供巨大直线运动的装置中。
一、永磁直线电机运行期间的保温散热问题，考虑到铜、铁的损耗，线圈会发热，造成几个负面影响:
线圈的绝缘层损坏或破坏，使线圈不便通过较大的电流，因而不产生较大的推力。
温度的升高会变动永磁体的工作点。
要是热量传递到机器工作台或直线导轨上，其热变形会影响加工精度，故此，尤其是平板式大推力直线电机，冷却时，磁钢温度不宜超过70℃，线圈温度不宜超过130℃。相对于动圈式和通常动磁直线电机，可对线圈部分做好冷却:却在动磁直线电机标准下，应使用双层水冷却方式，并配备温度传感器监测系统。U型直线电机考虑到结构原因，通常没冷却措施。
二、磁力分离和保护问题机床切削液、铁屑、粉尘等污染腐蚀电机，以至于堵塞气隙，使电机关闭。
永磁钢对铁磁性材料有很强的吸引力，因而隔磁，可使用不锈钢封闭。直线电机两端应具有缓冲保护装置和电子限位开关，以防执行机构失控后发生碰撞。电缆应使用拖链保护，输出信号线应屏蔽。
三、直线导轨标准承受载荷，改变高速运动并保证精度，直线导轨的选用需注意行程尺寸、机械特性、速度承载能力等。通常使用滚动(滚珠或滚轮)直线导轨，安装时要保证相互平行，相对于有标准的情况，可使用气动静压导轨。
伴随直线电机制造工艺的开拓创新，生产规模的不断扩大，及永磁材料和电子产品价格的不断下降，直线电机的成本以每年20%的速度下降，在机床上有巨大的应用范围。但这种使用是一种新事物，虽然直线电机实际上还是相应的数控技术，潜力都很大。
